Держфінмоніторинг діє на підставі Положення про Державну службу фінансового моніторингу, затвердженого постановою Кабінету Міністрів України від 17.09.2014 № 455.

Держфінмоніторинг утримується за рахунок коштів державного бюджету, є розпорядником бюджетних коштів третього рівня у системі мережі головного розпорядника коштів Міністерства фінансів України та здійснює видатки виключно в межах бюджетних асигнувань, затверджених в Державному бюджеті України на відповідний рік.

Згідно Закону України «Про Державний бюджет України на 2015 рік» Держфінмоніторингу встановлені бюджетні асигнування за такими бюджетними програмами:

- КПКВ 3509010 „Керівництво та управління в сфері фінансового моніторингу” – розпорядник бюджетних коштів Держфінмоніторинг;

- КПКВ 3509020 „Перепідготовка та підвищення кваліфікації у сфері боротьби з легалізацією (відмиванням) доходів, одержаних злочинним шляхом, і фінансуванням тероризму" – розпорядник бюджетних коштів Державний навчальний заклад післядипломної освіти “Навчально-методичний центр перепідготовки та підвищення кваліфікації спеціалістів з питань фінансового моніторингу в сфері боротьби з легалізацією (відмиванням) доходів, одержаних злочинним шляхом, і фінансуванням тероризму”, що знаходиться у сфері управління Держфінмоніторингу.

Сума затверджених Держфінмоніторингу України бюджетних асигнувань у 2015 році складає  26508,1 тис. грн., в тому числі в розрізі бюджетних програм та окремих статей витрат:

тис. грн.